Batman yaklaşık on yıldır Gotham şehri ile ilgilenmemiştir zaten bu sırada da ortada herhangi bir tehlike bulunmamaktadır. Ancak kısa süre önce şehir yine hareketlenmiştir ve bu hareketin sebebi ise mutant saldırılarıdır. Bu sırada Batman halen hükümet ile ortak bir noktada uzlaşamamıştır ve bu yüzden de tek başınadır. Ancak Gotham’ı tek başına bırakmak istemeyen Batman eskiden tanıdığı ve sözü geçen bir çeteden yardım alacaktır. Ancak bu yardım Batman için yeterli gelmeyecektir çünkü Batman hem Joker hem de Iron Man ile Gotham şehri için karşı karşıya gelmek zorunda kalacaktır.
