Mary yeni doğan bebeği Peter’ın boynuna bir kolye takarak onu yetimhanenin merdivenlerine bırakır. Yıllar sonra büyüyen Peter yetimhanedeki en yakın arkadaşı Nibs ile yetimler için yemek çalmaya çalışırken yakalanırlar. Bu sırada odada annesinin onun için yazdığı mektupları bulurlar. İlerleyen günlerde korsanlar Peter yakın arkadaşı Nibs ve birkaç yetim çocuğu kaçırırlar fakat Nibs son anda kaçmayı başarır ve korsanlar uçan gemileri ile oradan ayrılırlar. Karşılarına çıkan düşmanlar ile kısa bir hava saldırısı yaptıktan sonra çocukların yaşlanmasını önlemek için sürülen bir maddeyi bulmaya giderler. Peter bu yolculukta annesi Mary’e kavuşacağını düşünmektedir.