The Fly’ın ilk bölümünde Seth Brundle ışınlanmayı başarmıştı. Ancak bunu yaparken kapsüle giren bir sineği gözden kaçırmıştı. Bunun sonucunda ise kendisi bir sineğe dönüşmüş ve gazeteci sevgilisi Veronica tarafından öldürülmüştü. Rahmetli Brundle'ı çalıştıran şirket ise Veronica'nın, Brundle'ın çocuğunu doğurmasını bekler. Doğan bebeğe Martin adı verilir ve o da babası gibi laboratuvarda büyümeye başlar. Bu sırada Brundle'ın şirketinin sahibi olan Bartok, isimli adam, ışınlama makinesini daha da geliştirmeye çalışır. Tabi ki bu çalışmalara Martin de dahil edilecektir. Peki şimdi neler olacaktır?
